Novas internações por Departamento Regional de Saúde – 05/12/2022

Número de novas internações, em UTI ou enfermaria, de pacientes suspeitos ou confirmados de COVID-19 nos últimos 7 dias. Este parâmetro tem menor atraso de notificação, então responde mais rapidamente a tendências de curto prazo, mas a cobertura de hospitais que notificam varia ao longo do tempo, dificultando a comparação entre datas distantes ou a incidência total. Ele pode indicar controle da epidemia quando a curva atingir valores consistentemente baixos (próximo de zero novos casos) por mais de 30 dias.
Fonte: dados da Seade compilados a partir do Censo COVID SP, atualizados em 05-12-2022.
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Dados de testagem nos campi até 02/12/2022

Testes positivos para SARS-CoV-2 nas amostras coletadas nos campi da UFABC.
Fonte: Núcleo de Monitoramento e Testagem da UFABC.

A partir do dia 24 de maio de 2021, todos que necessitem comparecer aos Campi da UFABC durante a pandemia, no período de suspensão das atividades presenciais da Instituição, realizam o teste para detecção de SARS-CoV-2 em saliva, autocoletada. O teste consiste na detecção do vírus por transcrição reversa e reação em cadeia da polimerase (RT/PCR) quantitativo (em tempo real) utilizando dois marcadores direcionados à proteína do nucleocapsídeo viral. Para controle de qualidade dos ácidos nucléicos extraídos a partir da saliva é utilizado o marcador para a detecção do gene que codifica a RNAse P humana. O protocolo de RT/PCR quantitativo utilizado é recomendado pela Organização Mundial da Saúde (OMS) e o Centro de Controle de Doenças dos Estados Unidos (CDC), sendo considerado o padrão ouro na detecção do SARS-CoV-2.

Tabela de resultados dos testes:

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Novos casos hospitalizados por município – 28/11/2022

Número de novos casos hospitalizados (incidência de casos graves) confirmados com COVID-19, por dia de primeiro sintoma dos casos notificados, corrigido por nowcasting (pontos em vermelho) para os municípios de São Paulo, Santo André, São Bernardo do Campo, Mauá, São Caetano do Sul, Diadema, Guarulhos, Osasco, e Santos. As barras de erro correspondem à incerteza do nowcasting; a figura 1 é obtida a partir desses gráficos.
Fonte: Observatório Covid-19 BR, com dados da base SIVEP-Gripe de 2022-11-28;
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R efetivo por município – 28/11/2022

O número de reprodução efetivo da epidemia (Rt) representa o número de novos indivíduos infectados a partir de cada infecção, e é uma medida de aceleração da epidemia: se Rt for maior que 1, a epidemia se expande, se for menor que 1, os casos devem cair. Essa progressão é geométrica, então mesmo diferenças de 0.1 levam a diferenças grandes no número de casos após um mês. A incerteza depende tanto do número absoluto de casos (por isso é, por exemplo, menor em São Paulo), quanto da incerteza do nowcasting do número de casos, logo tende a ser grande no fim da série, o que põe em evidência as limitações do nosso conhecimento da trajetória atual da epidemia a partir dos dados disponíveis.
Fonte: Observatório Covid-19 BR, com dados da base SIVEP-Gripe de 2022-11-28.

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Incidência ponderada de casos graves – 28/11/2022

A incidência quinzenal de casos graves de COVID-19 ponderada pela composição da comunidade da UFABC dá uma ideia da probabilidade de uma pessoa da comunidade estar transmitindo a doença. A curva é plotada usando casos hospitalizados acumulados por 15 dias, dividido pela população total.
Fonte: Observatório Covid-19 BR, com dados da base SIVEP-Gripe de 2022-11-28.
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Incidência diária dos casos de SARS-CoV-2 – 30/11/2022

Incidência diária dos casos de SARS-CoV-2, demonstrada por pontos (círculo cinza), média móvel de sete dias (vermelho) e regressão local LOESS (azul), a partir do primeiro caso notificado à Secretaria de Estado da Saúde, em cada um dos municípios. A grande variação diária na notificação dos casos, principalmente aos finais de semana, é corrigida no cálculo da média móvel de sete dias. A regressão local permite observar a tendência de diminuição ou aumento da incidência ao longo do tempo enquanto que a observação da média móvel revela os valores de queda em números absolutos diários.
Fonte: dados da Secretaria Estadual de Saúde de São Paulo (Seade) de 25-02-2020 a 30-11-2022, por data de notificação.
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Incidência diária de óbitos por SARS-CoV-2 – 30/11/2022

Incidência diária dos óbitos decorrentes de infecção por SARS-CoV-2, demonstrada por pontos (círculo cinza), média móvel de sete dias (vermelho) e regressão local LOESS (azul), a partir do primeiro óbito notificado à Secretaria de Estado da Saúde, em cada um dos municípios. A observação do número de óbitos diários calculado pela média móvel de 7 dias registrados para cada município acompanha de certa forma as curvas de incidência descritas na figura 3. A relação entre a incidência de óbitos e de casos notificados pode auxiliar na observação da taxa de letalidade da doença na população. Uma diminuição dessa taxa poderia ser um reflexo de maior sucesso no tratamento dos doentes por parte das equipes médicas. Entretanto, é importante ressaltar que para que esse cálculo seja realizado é necessário conhecer o número total de casos por diagnóstico em massa ou por inferência a partir de inquéritos sorológicos. Estes dados não estão disponíveis para a grande maioria dos municípios que fazem parte da comunidade UFABC.
Fonte: dados da Secretaria Estadual de Saúde de São Paulo de 25-02-2020 a 30-11-2022, por data de notificação.
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